El Departamento de Ciencias Médicas se fundó en el año 1971, aunque con la denominación de Instituto de Investigaciones Médicas, y desde entonces ha desarrollado actividades de Investigación. Las actividades de Docencia comenzaron en 1981 con la formación del programa de Maestría en Ciencias Médicas y después en 1990 con el programa de Doctorado en Ciencias Médicas.

El Departamento se encuentra ubicado en la Sede 20 de Enero y cuenta con un aula para 40 alumnas y alumnos, cubículos para profesoras y profesores y 10 Laboratorios de investigación tanto clínica como básica, equipados con apoyos gestionados como Departamento o de manera independiente por cada investigadora o investigador.

Actualmente el DCM cuenta con 14 Profesoras y Profesores de Tiempo Completo (PTC), y con 4 técnicas y técnicos académicos que apoyan las actividades de investigación. Los PTC cuentan con Doctorado en Ciencias en diferentes áreas de especialización, siete de ellos en Ciencias Médicas, cinco en Ciencias Biomédicas, dos en Biología Experimental, uno en Química y uno en Nutrición.  En cuanto al nivel de consolidación, 3 PTC cuenta con nombramiento SNI 3, 4 PTC con SNI 2, y 7 PTC cuentan con SNI 1. En cuanto al perfil deseable de PRODEP 13 de las profesoras y profesores cuentan con el perfil.

Los PTC del Departamento de Ciencias Médicas forman el Núcleo Académico Básico de los programas de Maestría y Doctorado en Ciencias Médicas de la División de Salud. Además, los PTC imparten clases en la Maestría de Ingeniería Química, Maestría de Investigación Clínica y en las Licenciaturas de Médico Cirujano, Nutrición, Fisioterapia y Ciencias de la Actividad Física y Salud.

En la actualidad hay tres cuerpos académicos con registro de la SEP, uno consolidado, y 2 en consolidación.

Tanto la Maestría como el Doctorado, aportan un número importante de alumnas y alumnos activos a nuestra Universidad, así como de egresadas y egresados adscritos a distintas dependencias de la Universidad y de otras instituciones académicas y asistenciales públicas y privadas del país. 

Es importante destacar que el número de alumnas y alumnos que ingresan a cada programa ha ido en aumento de manera gradual, ya que cada vez un mayor número de estudiantes se interesa por estos programas de Investigación y las Líneas de Generación del Conocimiento que se ofertan en nuestro Departamento. Además, los programas cuentan con la participación de estudiantes extranjeros, en los últimos años hemos tenido alumnas y alumnos originarios de Sri Lanka, Cuba, Venezuela y Colombia, proporcionando carácter internacional y multicultural a nuestros programas de Posgrado.